Polná se encuentra en Bohemia, a unos 110 kilómetros al suroeste de Praga. Los judíos comenzaron a establecerse en Polná en el siglo XV. El gueto se creó en el siglo XVII; aún se pueden ver algunas de sus casas. La sinagoga se construyó en 1682.
Destruida por un incendio, fue restaurada en el siglo XIX. Sirvió como lugar de culto hasta 1936, y posteriormente se utilizó como almacén de bienes judíos confiscados. Tuvo un destino igualmente triste bajo el régimen comunista, que la utilizó para almacenar fertilizantes químicos. La sinagoga estuvo en un momento dado amenazada de demolición, pero fue salvada por el Club para la Antigua Polná, que la reparó después de 1989. En 1994, fue devuelta a la Federación de Comunidades Judías. Entre 2011 y 2014, la sinagoga y la residencia del rabino fueron objeto de importantes renovaciones como parte del programa de Revitalización de Monumentos Judíos.