La comunidad judía de esta pequeña ciudad sufrió las consecuencias más sangrientas del antisemitismo del siglo XII.

Los judíos estaban bien arraigados allí, entre la burguesía a la que prestaban servicios financieros. Pero la muerte del rey Enrique II, protector de los judíos, y la coronación de Ricardo I, conocido como Ricardo Corazón de León, provocaron disturbios antijudíos.
La masacre de Clifford’s Tower
Y fue durante la ausencia del rey, que había partido en cruzada, el 16 de marzo de 1190, cuando los barones, endeudados con los usureros judíos, decidieron sitiar el castillo (Clifford’s Tower) donde se habían refugiado. Acorralados, algunos se suicidaron; los demás fueron masacrados.
Hoy en día, un edificio de piedra se alza en el lugar donde se encontraba el antiguo castillo de madera, y los visitantes del monumento pueden conocer más detalles sobre aquella terrible masacre.
La sinagoga Aldwark prestó servicio a la comunidad judía de York desde 1886 hasta 1975. Sin embargo, con el declive de la comunidad, esta pasó a estar afiliada a la Leeds United Hebrew Congregation para los servicios religiosos y los entierros. Según el censo de 2001, la población judía de York asciende a cerca de 200 miembros. En 2014 se fundó una nueva comunidad liberal.