La presencia judía se remonta probablemente a la época romana. No obstante, los registros administrativos la atestiguan a partir del siglo XVII. A principios del siglo XX vivían en Niš unos 800 judíos, que se dedicaban principalmente a la industria textil, la artesanía y el comercio. El Holocausto se cobró numerosas víctimas entre la población judía de Niš y entre quienes se refugiaron allí durante la guerra. En la década de 1950, solo quedaban una veintena de judíos en Niš y la sinagoga se transformó en sala de conciertos.
En la colina de Bubanje se ha erigido un monumento dedicado a las víctimas del Holocausto. La antigua sinagoga se utiliza hoy en día como galería de arte y, en 2004, se rehabilitó un cementerio judío del siglo XVII.
Fuentes: Encyclopaedia Judaica