Fundada en 1833, la comunidad judía de La Chaux-de-Fonds se reunía en un piso de la calle Jaquet-Droz. Posteriormente, en 1853, una casa privada se convirtió en sinagoga. A partir de 1872 se utilizó un cementerio judío en el municipio de Les Eplatures.
La comunidad inauguró su sinagoga en 1896. El arquitecto Kuder se inspiró en la sinagoga de Estrasburgo, posteriormente destruida por los nazis. De estilo románico y construido en piedra tallada, el edificio cuenta con una cúpula octogonal con veinticuatro ventanas y tejas policromadas, y alcanza una altura de 32 metros. En la fachada, las Tablas de la Ley y dos torretas. En el interior, la cúpula central y las cuatro cúpulas pequeñas de las esquinas son multicolores, en armonía con las vidrieras. El motivo principal es una estrella de David, de la que parten rayos que llevan los nombres de personajes bíblicos en un cielo estrellado.
En 1900, La Chaux-de-Fonds era la cuarta ciudad suiza con mayor número de habitantes de confesión judía, por detrás de Zúrich, Basilea y Ginebra. Allí vivieron grandes figuras de la industria relojera. Entre las demás profesiones ejercidas por los judíos de La Chaux-de-Fonds se encuentran la artesanía, el comercio de antigüedades y la enseñanza. También desempeñan un papel importante en las artes y la cultura, así como en el mundo del deporte.
En la segunda mitad del siglo XX, la población judía se redujo drásticamente. Así, a principios de la década de 2000 se contabilizaban 70 judíos.