Aunque en documentos de la Edad Media se menciona una presencia judía en Belfort, el establecimiento de una comunidad no se materializó hasta finales del siglo XVIII. Su presencia en ciudades vecinas como Foussemagne es más antigua. La emancipación de los judíos de Francia, impulsada por el espíritu y la autoridad de la Revolución Francesa, facilitó su asentamiento.
Así, a partir de 1791, se instalaron principalmente en el casco antiguo. El primer nacimiento se celebró al año siguiente y la primera boda judía, un año más tarde. La comunidad contaba con 475 judíos en 1823.
En 1830 se construyó una sinagoga, que fue demolida poco después, ya que se encontraba enclavada en un terreno militar. La sinagoga actual fue inaugurada el 26 de marzo de 1857 por Salomon Wolf Klein, gran rabino del Alto Rin.
La sinagoga fue construida por el arquitecto Diogène Poisat Aîné. La fachada del edificio es de estilo romano-bizantino. Cuenta con dos pabellones con cúpulas simétricas y tres portales. En el interior, el arco está coronado por una vidriera en forma de rosetón. Esta está decorada con motivos florales y arabescos. La sinagoga está incluida en el patrimonio regional por una razón adicional: la presencia de un reloj Ungerer de mediados del siglo XIX.
La comunidad creció a partir de 1870 con la llegada de judíos de Alsacia. Posteriormente, se sumaron judíos polacos. De los 700 judíos que vivían allí antes de la Segunda Guerra Mundial, 245 fueron asesinados. Tras la guerra, la comunidad se reconstruyó con la llegada de judíos europeos y, más tarde, del norte de África.
Belfort cuenta también con un cementerio judío que data de 1811. El Departamento del Territorio de Belfort organiza visitas guiadas.
En diciembre de 2024 se inauguró una placa conmemorativa en la sinagoga de Belfort. Esto fue posible gracias al minucioso trabajo de Nadia Hofnung, en memoria de los rabinos y presidentes de la comunidad judía de Belfort desde 1791. La historiadora también investiga el destino de las mujeres deportadas durante la Segunda Guerra Mundial en el norte de la Franche-Comté. Con el fin de honrar su memoria, pero también para servir de apoyo a los docentes.