La presencia judía en Toulon se remonta al menos al siglo XIII, pero se han encontrado pocos documentos escritos de la época al respecto. En 1285 se celebró una asamblea general de ciudadanos, en cuya lista figuran los nombres de once judíos.
Dado que la población judía era escasa en aquella época, a los pocos judíos de la ciudad no se les animaba a vivir en un barrio concreto, por lo que residían principalmente en la zona central del casco antiguo de Toulon, cerca de la actual calle des Tombades. Además, gozaban de numerosos derechos.
Tras la masacre de cuarenta judíos en la noche del 13 al 14 de abril de 1348, la presencia judía fue prácticamente inexistente hasta la Revolución Francesa. A algunos judíos se les animó a convertirse y un puñado de ellos vivieron allí de forma temporal.
Así pues, no fue hasta el siglo XIX cuando volvió a formarse una pequeña comunidad judía en Toulon. Antes del Holocausto, vivían allí unas cincuenta familias, procedentes principalmente de Alsacia. Gracias a la llegada de judíos del norte de África en la década de 1960, la comunidad contaba con 2000 personas en 1971. Una cifra que aumentó a 2000 familias a principios del siglo XXI.
La ciudad de Toulon cuenta con dos sinagogas: el Centro Comunitario Israelita de Toulon y del Var y la sinagoga de la ACIT .