Alytus es una ciudad situada a orillas del río Nemunas, por la que discurren las principales carreteras que conectan las grandes ciudades del país.
Hoy en día quedan pocos vestigios de la vida judía en Alytus. La sinagoga , construida con ladrillos amarillos y rojos, data de 1911. La elección de este tipo de ladrillos, que se diferenciaba de las sinagogas de madera típicas de la región, se debió a un incendio que había devastado la sinagoga de madera de la ciudad poco tiempo antes.
Durante la era soviética, el edificio se utilizó como almacén y posteriormente quedó abandonado. La decoración interior ha resistido el paso del tiempo. Actualmente se están llevando a cabo proyectos de restauración para convertirlo en un centro cultural. La ciudad cuenta también con un cementerio judío .