Alytus est une ville se trouvant sur la rivière Nemunas et est traversée par les grandes routes reliant les grandes villes du pays.
Il demeure aujourd’hui peu de traces de la vie juive d’Alytus. La synagogue, construite avec des briques jaunes et rouges date de 1911. Le choix de briques, se différenciant des synagogues en bois du pays, fut déterminé suite à un feu qui ravagea la synagogue en bois de la ville quelque temps auparavant.
Durant l’ère soviétique, le bâtiment fut utilisé comme entrepôt, puis laissé à l’abandon. Des décorations intérieures ont survécu au temps. Des projets de restauration pour en faire un centre culturel sont en cours. La ville compte également un cimetière juif.