La presencia judía en Sicilia parece remontarse al menos a dos mil años atrás. Así lo atestiguan ciertos vestigios arqueológicos y las experiencias de personalidades de la época, como el historiador Cecilio de Calacta. Las diferentes conquistas de la isla, en particular por parte de los árabes y los normandos a lo largo de los siglos, también evocan su presencia. Ya sea en las ciudades de Palermo, Siracusa, Naso, Mesina o Catania.
En 1171, Benjamín de Tudela menciona en su diario de viaje la existencia de comunidades judías en las ciudades de Palermo y Mesina.
En el siglo XIV, Federico II (1296-1337) protegió a los judíos frente a las persecuciones de las Cruzadas y las amenazas religiosas, permitiéndoles además ejercer diversos oficios, especialmente en el sector de la seda. Sin embargo, no se les permitió ejercer profesiones en el ámbito de la medicina ni en la administración pública. Federico III concedió una protección similar a los judíos frente a las amenazas religiosas.
Desde finales del siglo XIV hasta 1474, la situación de los judíos mejoró, sobre todo con la supresión de las restricciones profesionales y urbanísticas.
Sin embargo, ese año fueron masacrados 360 judíos en la ciudad de Modica. Y, probablemente, cerca de 500 en Noto. La espiral de violencia continuó, a pesar de los ocasionales intentos de los dirigentes por protegerlos.
A raíz de las medidas adoptadas por la Inquisición en España, los entre 30 000 y 40 000 judíos de Sicilia se vieron obligados a abandonar la isla cuando se publicó un decreto en 1493.
La mayoría se marchó, algunos se convirtieron y otros vivieron como marranos. En aquel entonces había unas cincuenta comunidades, de las cuales la más grande era la de Palermo, con 5 000 judíos.
Desde entonces, pocos judíos regresaron, a pesar de algunos intentos, principalmente en el siglo XVIII. Se calcula que, en 1965, solo unos cincuenta judíos vivían allí. No obstante, investigaciones recientes ponen de manifiesto el gran número de sicilianos que probablemente tienen orígenes judíos.
El descubrimiento de un mikvé en 1987 en la ciudad de Siracusa suscitó un renovado interés por el patrimonio cultural judío de la isla. Sobre todo porque el mikvé se encontraba en muy buen estado de conservación. El rabino Di Mauro, que nació en Sicilia antes de emigrar a Estados Unidos, regresó a la isla en 2007 y reactivó la vida judía.
En la década de 2000, varias asociaciones comenzaron a organizar festividades, investigaciones y conferencias en Palermo, en particular a través del Instituto Italiano de Estudios Judíos, con el fin de dar a conocer la historia judía de Sicilia. Todo ello en colaboración con la comunidad judía de Nápoles, la principal del sur de Italia.