La ciudad lleva el nombre de Bagnos («pequeño baño»), al que se le añadió «les-Juifs» tras la llegada de numerosos judíos a esta nueva aglomeración.

La presencia judía parece remontarse al siglo XIII. La sinagoga medieval estaba situada en la calle Vergier-au-Duc .
Sin embargo, a finales de la Edad Media, al igual que en muchos otros lugares de Francia de la época, los judíos fueron expulsados de la ciudad.