Los judíos daneses evacuados durante la ocupación nazi llegaron en barco a Malmö, gracias a la intervención del conde Folke Bernadotte. Algunos fallecieron poco después de su llegada y fueron enterrados en el cementerio de la ciudad, donde un monumento les rinde homenaje.
En esta ciudad situada a orillas del Báltico, frente a Copenhague, se fundó más tarde, en 1871, tras la emancipación, una comunidad (originaria de judíos alemanes). Actualmente cuenta con 1200 miembros. Su centro comunitario se construyó en 1962 y fue financiado en parte con reparaciones alemanas. Una sinagoga ortodoxa funciona en la Föreningsgatan, en la esquina de Betaniaplan. Construida en 1903, es de estilo oriental y cuenta con un tejado abovedado que recuerda al de las iglesias ortodoxas.
La comunidad de Malmö se ha extendido por los alrededores: la de Lund solo se reúne con motivo de las fiestas, mientras que la de Helsingborg está activa todo el tiempo. Por el contrario, las comunidades de Landskrona y Kristianstad cerraron a principios de la década de 1990. El interior de la sinagoga de Kristianstad es ahora utilizado por una comunidad de origen escandinavo en Raanana, Israel.
Desde hace unos veinte años, una ola de atentados antisemitas ha azotado Suecia, especialmente la ciudad de Malmö, principalmente a causa de movimientos neonazis e islamistas. Se trata tanto de agresiones a supervivientes del Holocausto como de actos de vandalismo en cementerios e incendios de lugares de culto. En 2012 se colocó un explosivo frente al centro comunitario. Cinco años más tarde, se profirieron consignas antisemitas en una manifestación y se incendió la capilla del cementerio judío. En 2020, durante una manifestación islamista, se lanzaron llamamientos al asesinato de judíos.
Estos incidentes, especialmente frecuentes en esta ciudad, han obligado a los judíos suecos a abandonarla para trasladarse a Israel o a otros lugares donde se sienten más seguros. Por lo tanto, el número de judíos se ha reducido considerablemente, a la mitad, hasta llegar a menos de 1000 personas en la actualidad.
En 2025, con motivo del 250.º aniversario de la comunidad judía de Malmö, la ciudad organiza numerosos actos, en estrecha colaboración con la comunidad judía de Malmö. Entre ellos, una exposición dedicada a las heroínas judías, que se podrá visitar en varias bibliotecas municipales.