La presencia judía en Lucerna se remonta probablemente al siglo XIII. Durante la Edad Media, al igual que en muchas otras ciudades de la región, la situación de los judíos osciló entre la acogida, las persecuciones y las expulsiones, dependiendo del poder vigente. En la oleada de grandes expulsiones que tuvo lugar entre finales del siglo XIV y finales del XV, los judíos de Lucerna fueron expulsados en 1384.
A principios del siglo XIX se restableció la comunidad judía en Lucerna. En aquel entonces había un lugar de culto, un mikvé, una escuela y asociaciones sociales. En 1912 se construyó la sinagoga de Lucerna gracias al apoyo de Josef Croner, un habitante de Karlsruhe entusiasmado con la ciudad y la comunidad. Fue diseñada por el arquitecto Max Seckbach.
Aunque muchas personas encontraron refugio en el periodo de entreguerras y durante el Holocausto, la población judía se redujo en la segunda mitad del siglo XX, principalmente hacia otras ciudades del país.
En 2025, había unas cuarenta familias judías en Lucerna.