La présence juive lilloise est indiquée dès le Moyen-Age. De nombreuses rue des Juifs existent dans la région à cette époque, notamment à Lille, Bavai, Maroilles et Sains.
En 1023, trente juifs de Lorraine sont autorisés par le Comte de Baudouin à s’établir dans le Nord, dans les villes de Hautmont, Bavai et Cambrai. A l’image des autres communautés juives de la région, les juifs sont expulsés du Royaume en 1394.
Leur retour dans la région se concrétisa à la veille de la Révolution, avec la venue notamment de juifs alsaciens. Lors de la création des consistoires, le Nord dépendait de celui de Paris. En 1809, selon un recensement, il y avait cent soixante-six juifs dans Nord et soixante-trois dans le Pas-de-Calais.
En 1891, la synagogue de Lille est inaugurée. Le bâtiment est de style romano-byzantin. Le nef de 17 mètres est soutenue par douze piliers de fonte symbolisant les douze tribus. Une sculpture des Tables de la Loi se trouvent au sommet de la synagogue.
En 1932, il y a plus de cinq cents familles juives lilloises, 90 aux environs de la ville, 116 à Valenciennes et ses environs, 300 à Lens et ses environs, 45 à Douai, 44 à Roubaix-Tourcoing, 33 à Dunkerque, 30 à Boulogne-sur-Mer, 16 à Calais et 40 à Amiens
Parmi les grandes personnalités de la ville, Armand Lipman, né en 1857, est le fils du Grand Rabbin du Lille : Benjamin Lipman. Officier sorti de polytechnique, il combattit pendant la Première Guerre mondiale, comme ses trois fils. Le Commandant Lipman fut surtout connu comme journaliste, participant aux revues Foi et Réveil, L’Univers Israélite, Archives Israélites et la Revue Juive de Lorraine. Il participe également aux activités de l’Alliance Israélite Universelle.
De nombreux réfugiés s’installèrent dans l’entre-deux-guerres dans la région de Lille. Pendant l’occupation, en octobre 1941, 987 Juifs furent recensés pour le département du Nord, les autres ayant choisi l’exil. Lille et le Nord relevant du Gouvernement militaire de Bruxelles, la grande rafle se déroula en même temps que celles de Belgique : le 11 septembre 1942. Des Juifs furent arrêtés et emmenés par trains jusqu’à Malines et d’autres parqués dans des camps de travail pour édifier le Mur de l’Atlantique de l’été 1942 à l’été 1944.
Les survivants de la Shoah rebâtirent la communauté après la guerre. Une présence renforcée par l’arrivée des sépharades dans les années 60. Il y a aujourd’hui environ 3000 juifs dans la région lilloise.