La ville de Joniskis est assez ancienne, remontant au 16e siècle. La présence juive à Joniskis date du 18e siècle. Ils vécurent principalement autour des synagogues principales.
Avant la Shoah, la population juive de la ville représentait près de la moitié des habitants. Une grande majorité furent massacrés, comme dans l’ensemble du pays. Il ne reste plus de juifs à Joniskis aujourd’hui, mais la petite communauté de Siauliai participa à la ré-inauguration de ses synagogues.
Deux synagogues datant du 19e siècle sont situées l’une à côté de l’autre au centre de la ville, nommées en fonction de leur couleur.
La synagogue blanche fut construite en 1823. Elle servit également d’école juive. La synagogue rouge fut construite en 1865. Lors de la période soviétique, celle-ci fut transformée en lieu résidentiel et centre pour la jeunesse.
Le complexe formé par les deux synagogues fut placé sous le patronat du ministère de la culture lituanien en 1970. Une restauration fut entreprise suite à l’indépendance du pays à la fin des années 1990. Fortement endommagée en 2004 et 2007 suite à des tempêtes, les murs détruits furent reconstruits grâce à l’aide des institutions européennes et de la Norvège, en partenariat avec les autorités locales.
Depuis 2014, la synagogue rouge sert de centre culturel. La synagogue blanche a également bénéficié des aides européennes afin d’être restaurée en 2017.
Sources : JTA