La présence juive à Northampton date probablement du Moyen Age. Elle fut au 12^e siècle une des plus grandes communautés du pays. Durant le 13^e siècle ils furent tantôt accueillis, tantôt persécutés et exclus, selon les dirigeants et directives.

Des juifs retournèrent dans la ville au fil des siècles. Une communauté vit le jour au 19^e siècle, avec la formation de la  Northampton Hebrew Congregation en 1888. Elle acheta un lieu deux ans plus tard pour y installer une synagogue, sur Overstone road. Elle fut détruite et reconstruite sur le même lieu en 1965.

La population juive fut modeste de cette époque à aujourd’hui, avec un pic pendant la Seconde Guerre mondiale, lorsque des juifs londoniens s’y réfugièrent. Ainsi, on ne compta que 300 juifs en 1969 et 322 en 2001 en une centaine aujourd’hui. La communauté juive utilise le cimetière de  Towcester Road .

Une  synagogue médiévale a été découverte en 2010 par Marcus Roberts, le directeur de JTrails, un organisme recherchant le patrimoine culturel juif anglais. Elle date probablement du 13^e siècle. Elle est située sous un pub et un fast food.